65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4094 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.46 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  39.46 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.55 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.55 
 
 		 561 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.33 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  29.28 
 
 		 432 aa  91.3  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.39 
 
 		 390 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.12 
 
 		 467 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  29.63 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.9 
 
 		 482 aa  88.6  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.9 
 
 		 482 aa  88.6  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.9 
 
 		 482 aa  88.6  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.9 
 
 		 482 aa  88.6  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  38.93 
 
 		 521 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  31.52 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  31.52 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.95 
 
 		 522 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.1 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1501  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.67 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124418  hitchhiker  0.00011346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  37.74 
 
 		 200 aa  84.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  35.03 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.03 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  32.07 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.25 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5534  plasmid pRiA4b ORF-3-like  28.49 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7639  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.49 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.86 
 
 		 383 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  34 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3157  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.9 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.660843  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.61 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3350  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.9 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  30.11 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  28.09 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5189  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.76 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3019  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.19 
 
 		 230 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.11 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4882  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.14 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1921  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.96 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.17 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  35.33 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4604  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.74 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04841  hypothetical protein  29.05 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.99 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  26.82 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  26.82 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  26.82 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  26.82 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  26.82 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  26.82 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  30.14 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.91 
 
 		 464 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  28.21 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.59 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31.62 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.93 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.77483  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  29.1 
 
 		 237 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1254  hypothetical protein  25.83 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0603  hypothetical protein  32.65 
 
 		 85 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1536  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.17 
 
 		 512 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5922  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  36.73 
 
 		 114 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4150  hypothetical protein  31.93 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  31 
 
 		 130 aa  41.6  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1853  hypothetical protein  23.48 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>