11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2253 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2253  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  708    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1472  hypothetical protein  84.37 
 
 		 339 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2405  hypothetical protein  77.58 
 
 		 339 aa  564  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  44.54 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0409  hypothetical protein  33.45 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.550319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2235  hypothetical protein  35.51 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.271057  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  26.84 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0292  metal-binding protein  25.37 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  26.61 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2645  hypothetical protein  26.09 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4625  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  32.5 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>