113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0335 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0335  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1132    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.819744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  34.25 
 
 		 488 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0530  hypothetical protein  32.79 
 
 		 516 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0120  hypothetical protein  29.57 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0276  hypothetical protein  25.4 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  36.84 
 
 		 221 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  54.05 
 
 		 1024 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  51.22 
 
 		 1010 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  63.64 
 
 		 293 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  46.51 
 
 		 910 aa  50.1  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  62.5 
 
 		 283 aa  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 1200 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  41.3 
 
 		 836 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  55.88 
 
 		 291 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  62.07 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 1031 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 896 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  94.44 
 
 		 160 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 866 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  37.5 
 
 		 962 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  37.5 
 
 		 962 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  37.5 
 
 		 962 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  54.55 
 
 		 276 aa  47.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  35.09 
 
 		 992 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  54.55 
 
 		 276 aa  47.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  30.14 
 
 		 319 aa  47.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 1277 aa  47.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  32.35 
 
 		 222 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  60.61 
 
 		 838 aa  47.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  42.67 
 
 		 1022 aa  47  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  54.84 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  62.96 
 
 		 286 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  80.95 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  29.91 
 
 		 267 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  36.59 
 
 		 162 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  35.53 
 
 		 916 aa  46.6  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  54.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 		 845 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  85 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  54.55 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  65.52 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 864 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 896 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  65.22 
 
 		 731 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 888 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  69.57 
 
 		 150 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  56.25 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  29.91 
 
 		 237 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 897 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  69.57 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 1029 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 958 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  55.88 
 
 		 259 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  36.11 
 
 		 844 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 834 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 1136 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 848 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  57.14 
 
 		 384 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 731 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 957 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  76.19 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  46.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 272 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  88.89 
 
 		 158 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 858 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  62.5 
 
 		 260 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  88.89 
 
 		 160 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  48.98 
 
 		 1113 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  46.34 
 
 		 1067 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  88.89 
 
 		 158 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  56.67 
 
 		 291 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  56.67 
 
 		 291 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  72.73 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 881 aa  44.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 278 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  32.56 
 
 		 914 aa  44.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  65.22 
 
 		 104 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  69.57 
 
 		 420 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  83.33 
 
 		 264 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 800 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  83.33 
 
 		 202 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  27.27 
 
 		 917 aa  43.9  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  77.78 
 
 		 921 aa  43.9  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>