More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1651 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  866    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  88 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 848 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  77.78 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 897 aa  56.2  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  80.77 
 
 		 593 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 837 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 845 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 864 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 896 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  86.96 
 
 		 921 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  86.96 
 
 		 921 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 866 aa  53.9  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 837 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  90.91 
 
 		 167 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 834 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 278 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 1029 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 1031 aa  53.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  95.24 
 
 		 259 aa  53.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 910 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 858 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  67.74 
 
 		 267 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  67.74 
 
 		 237 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  77.78 
 
 		 253 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 844 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 838 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 888 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 859 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  95 
 
 		 110 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  79.17 
 
 		 535 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 836 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 855 aa  51.2  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  80.95 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  86.96 
 
 		 151 aa  51.2  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3880  hypothetical protein  81.82 
 
 		 135 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0869026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  86.36 
 
 		 228 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 922 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  81.82 
 
 		 231 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 909 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 1017 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 111 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 1136 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  74.07 
 
 		 260 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 161 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 958 aa  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 112 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4023  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 133 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  90 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  86.36 
 
 		 993 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  70.37 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  62.07 
 
 		 919 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 957 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 912 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 170 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  85 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  76 
 
 		 167 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2687  SEC-C motif domain protein  61.54 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.182718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  80.95 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  82.61 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  76 
 
 		 235 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  81.82 
 
 		 112 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  85 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 61 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 110 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 1200 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  72 
 
 		 257 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 962 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  69.23 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 896 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 944 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 872 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 881 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  86.36 
 
 		 962 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  73.08 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  73.91 
 
 		 658 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  81.82 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 894 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  78.26 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  82.61 
 
 		 169 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 962 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 899 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 833 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 896 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 904 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 135 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>