252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2179 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  65.77 
 
 		 111 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 111 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  63.06 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  57.66 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  57.01 
 
 		 110 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  56.88 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  55.56 
 
 		 110 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  53.7 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  50.93 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  44.74 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  73.33 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 888 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  70.37 
 
 		 432 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  62.16 
 
 		 260 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 855 aa  50.8  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  67.86 
 
 		 278 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 1031 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  59.46 
 
 		 283 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  38.14 
 
 		 910 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  90 
 
 		 420 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  50.98 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 1029 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  51.11 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 896 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  81.82 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  30.84 
 
 		 894 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  81.82 
 
 		 259 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  30.77 
 
 		 838 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 1027 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  94.44 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 896 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  40 
 
 		 921 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 897 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 419 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 958 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 957 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 845 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  66.67 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  30.28 
 
 		 844 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 912 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  62.96 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  62.96 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  47.37 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 384 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 864 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 593 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  30.84 
 
 		 836 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  42.37 
 
 		 848 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 866 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 834 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 1017 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 872 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 274 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 858 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 291 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 837 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 		 800 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 912 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 921 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  30.84 
 
 		 833 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  94.44 
 
 		 253 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 1200 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  69.57 
 
 		 231 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  31.78 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  31.19 
 
 		 962 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  83.33 
 
 		 658 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  47.5 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  31.19 
 
 		 962 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  66.67 
 
 		 909 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 378 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1635  hypothetical protein  59.38 
 
 		 429 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.223926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  84.21 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  31.19 
 
 		 962 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1973  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 449 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 881 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 910 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  66.67 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  94.44 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 859 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 291 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  94.44 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>