296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3867 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 110 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  54.63 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  54.55 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  52.78 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  52.78 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  52.78 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  55.56 
 
 		 111 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  52.78 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  53.7 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  54.63 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  49.07 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  50.93 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  48.18 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  46.32 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  43.24 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  44.29 
 
 		 278 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  49.02 
 
 		 384 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  70.97 
 
 		 272 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 		 319 aa  50.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 1029 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  63.33 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  32.5 
 
 		 944 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  90.48 
 
 		 283 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  70.97 
 
 		 276 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  70.97 
 
 		 276 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  32.5 
 
 		 962 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  32.5 
 
 		 962 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  32.5 
 
 		 962 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  31.43 
 
 		 838 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  41.07 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  29.91 
 
 		 836 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  80.95 
 
 		 432 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  31.25 
 
 		 864 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 1031 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  90 
 
 		 420 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  78.26 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  41.07 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  90 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 848 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  41.07 
 
 		 888 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 855 aa  47.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 535 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 593 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 845 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 896 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 921 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  70 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 897 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 866 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 834 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 921 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  35.71 
 
 		 658 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 858 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 957 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  31.82 
 
 		 837 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  94.44 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  31.62 
 
 		 906 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 958 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 		 800 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  47.73 
 
 		 228 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  30.48 
 
 		 835 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  51.16 
 
 		 922 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  80 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 910 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  60.71 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  29.52 
 
 		 835 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 1200 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2581  SecC motif-containing protein  78.95 
 
 		 426 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00102594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1635  hypothetical protein  84.21 
 
 		 429 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.223926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  94.44 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  30.48 
 
 		 835 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 291 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  29.52 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  29.52 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  29.52 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  29.52 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 881 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 844 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  88.89 
 
 		 214 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 378 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  29.52 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  29.52 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  58.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  73.08 
 
 		 291 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 896 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  89.47 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  66.67 
 
 		 909 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 912 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 837 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>