100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2581 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2581  SecC motif-containing protein  100 
 
 
426 aa  877    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00102594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1635  hypothetical protein  52.79 
 
 
429 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.223926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  48.84 
 
 
848 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 
897 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  60.71 
 
 
909 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 
894 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  37.66 
 
 
1067 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 
888 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  41.51 
 
 
164 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  65.38 
 
 
239 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  44.19 
 
 
1029 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 
859 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  37.5 
 
 
593 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  55.88 
 
 
164 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 
1200 aa  46.6  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 
837 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 
921 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 
272 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
912 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  73.68 
 
 
859 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 
1136 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  48.84 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 
896 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 
834 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 
1031 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 
535 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 
866 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  75 
 
 
112 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 
845 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  75 
 
 
112 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  75 
 
 
112 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
958 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  75 
 
 
112 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  75 
 
 
112 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  73.68 
 
 
910 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 
864 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  84.21 
 
 
249 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 
957 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  78.95 
 
 
110 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 
921 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
837 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  53.12 
 
 
858 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1588  SecC motif-containing protein  25.55 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000121054  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
838 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  38.78 
 
 
910 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0831  hypothetical protein  40.48 
 
 
869 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
836 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
855 aa  45.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 
872 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  46.51 
 
 
904 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  46.51 
 
 
904 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  25.58 
 
 
836 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  46.51 
 
 
904 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  65.22 
 
 
202 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  83.33 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  83.33 
 
 
283 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  54.55 
 
 
421 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  42.11 
 
 
993 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  78.95 
 
 
830 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 
162 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
869 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  26.74 
 
 
835 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  88.24 
 
 
296 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 
276 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 
276 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 
844 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  43.14 
 
 
939 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  77.78 
 
 
235 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  48.84 
 
 
858 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  62.96 
 
 
161 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  56.67 
 
 
881 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 
922 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  50 
 
 
253 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  56.67 
 
 
658 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  66.67 
 
 
110 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 
135 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  58.62 
 
 
291 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  77.78 
 
 
228 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  61.54 
 
 
228 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  60 
 
 
222 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  47.62 
 
 
899 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1973  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 
449 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  32.29 
 
 
956 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  68.42 
 
 
901 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  78.95 
 
 
111 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  78.95 
 
 
111 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  78.95 
 
 
264 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  42.55 
 
 
911 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>