209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3510 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  100 
 
 
112 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  100 
 
 
112 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  99.11 
 
 
112 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  96.43 
 
 
112 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  93.75 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  70.27 
 
 
111 aa  173  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  70.27 
 
 
111 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  68.47 
 
 
112 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  63.96 
 
 
111 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  63.06 
 
 
112 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  63.3 
 
 
110 aa  143  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  53.27 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  52.78 
 
 
110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  63.06 
 
 
111 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  47.22 
 
 
110 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  49.12 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 
110 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  36.54 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
855 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  59.38 
 
 
225 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  35.05 
 
 
910 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  37.93 
 
 
1027 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 
272 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  40.85 
 
 
906 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 
888 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  51.02 
 
 
1017 aa  48.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  68 
 
 
909 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  39.13 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 
838 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  31.53 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
912 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  30.68 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  76.19 
 
 
420 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
894 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  32.46 
 
 
944 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
1029 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  41.51 
 
 
276 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
896 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  55.56 
 
 
432 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  52.38 
 
 
283 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  30.68 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2581  SecC motif-containing protein  75 
 
 
426 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00102594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
844 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  41.51 
 
 
276 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
957 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
958 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  66.67 
 
 
231 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  30.68 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 
1031 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  58.06 
 
 
249 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  54.84 
 
 
264 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1635  hypothetical protein  54.55 
 
 
429 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.223926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  32.86 
 
 
278 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  73.91 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  48.72 
 
 
1200 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  69.57 
 
 
658 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  28.33 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  69.57 
 
 
800 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  35.71 
 
 
669 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  72.73 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
897 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  57.14 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 
896 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 
845 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  32.39 
 
 
837 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  38.03 
 
 
939 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 
866 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
869 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  68.18 
 
 
535 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  32.88 
 
 
901 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 
859 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  25.26 
 
 
904 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  39.34 
 
 
848 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  25.26 
 
 
904 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  25.26 
 
 
904 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  68.18 
 
 
593 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  75 
 
 
259 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  64 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  48.72 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 
910 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  29.46 
 
 
962 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  29.46 
 
 
962 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 
907 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  68.18 
 
 
239 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  29.46 
 
 
962 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 
419 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 
906 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  29.63 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  64 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  45.24 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1534  SEC-C motif domain protein  41.3 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.215739  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>