231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1534 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1534  SEC-C motif domain protein  100 
 
 
193 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.215739  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6040  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0520427  normal  0.280208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3570  SEC-C metal-binding protein  35.06 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2267  hypothetical protein  42 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402532  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1140  SEC-C metal-binding protein  28.57 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0132  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  45.28 
 
 
888 aa  51.6  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  43.64 
 
 
848 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1607  hypothetical protein  30.65 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 
800 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 
838 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 
866 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 
896 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2871  hypothetical protein  31.4 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0703409  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 
1200 aa  48.9  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  85.71 
 
 
264 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  47.5 
 
 
267 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
897 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  47.5 
 
 
237 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 
896 aa  48.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 
257 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  52.94 
 
 
158 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  65.38 
 
 
419 aa  47.8  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  52.94 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 
864 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  52.94 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 
858 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 
836 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  47.62 
 
 
1136 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  72.73 
 
 
384 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 
844 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  70.83 
 
 
593 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 
837 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  70.83 
 
 
135 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  73.91 
 
 
253 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  43.14 
 
 
1067 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 
834 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  75 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 
894 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 
535 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 
910 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  40.62 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  69.57 
 
 
618 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 
881 aa  45.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 
859 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  64.29 
 
 
378 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  40.3 
 
 
160 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 
921 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  68.18 
 
 
228 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  72.73 
 
 
228 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  61.54 
 
 
276 aa  44.7  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  61.54 
 
 
276 aa  44.7  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  45.28 
 
 
962 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 
922 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  72.73 
 
 
162 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  75 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
906 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
957 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  30.65 
 
 
148 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  76.19 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  80 
 
 
259 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  45.28 
 
 
962 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  62.5 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  68.18 
 
 
421 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 
872 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  39.22 
 
 
112 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  62.5 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 
944 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  62.5 
 
 
909 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
906 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
958 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 
912 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  45.28 
 
 
962 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  75 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  39.13 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
904 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  78.95 
 
 
731 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  84.21 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
904 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  55.26 
 
 
432 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  84.21 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  72.73 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 
921 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 
909 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
904 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  62.5 
 
 
830 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  70 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  57.69 
 
 
249 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  72.73 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 
833 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 
899 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  47.06 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 
920 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 
917 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 
980 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>