More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002976 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  81.68 
 
 		 202 aa  352  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  60.68 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2150  hypothetical protein  51.27 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  27.81 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  79.17 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  79.17 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  60.61 
 
 		 916 aa  55.5  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  79.17 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  79.17 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  47.54 
 
 		 1200 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  64.71 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  57.58 
 
 		 920 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 910 aa  51.6  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  26.26 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  68 
 
 		 945 aa  50.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  69.23 
 
 		 909 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  34.57 
 
 		 937 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 866 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 836 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 1031 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  54.05 
 
 		 896 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 421 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  56.41 
 
 		 864 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  26.26 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 834 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 894 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 865 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  52.38 
 
 		 888 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  30.11 
 
 		 535 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  40.68 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 912 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 900 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  26.26 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  26.26 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 1136 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 384 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  27.41 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 1113 aa  49.3  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  27.41 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  27.41 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 897 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  27.41 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  54.55 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 936 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 858 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 		 897 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  27.41 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  30.09 
 
 		 909 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 921 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  22.38 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 916 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 922 aa  48.5  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  22.38 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  26.26 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 930 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 881 aa  48.5  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  62.07 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  90 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 924 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  60.61 
 
 		 917 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 838 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  66.67 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  72 
 
 		 58 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  72 
 
 		 618 aa  48.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  57.58 
 
 		 908 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  47.5 
 
 		 939 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  69.57 
 
 		 901 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  85.71 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 		 901 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 842 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  48.89 
 
 		 1032 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 901 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  85.71 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 907 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 931 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  52.63 
 
 		 932 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  47.5 
 
 		 908 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  47.5 
 
 		 908 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 286 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 859 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 901 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 908 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  29.09 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  30.58 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 922 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  30.33 
 
 		 276 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 904 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 915 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>