260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4839 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1342    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2144  SecC motif-containing protein  28.42 
 
 		 601 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  27.98 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  27.76 
 
 		 489 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  30.33 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  62.86 
 
 		 921 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 278 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 844 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 921 aa  54.3  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  57.89 
 
 		 845 aa  54.3  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  26.78 
 
 		 269 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 838 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 881 aa  52.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 836 aa  52  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  52.27 
 
 		 930 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  42.03 
 
 		 834 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 864 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  68 
 
 		 910 aa  51.6  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 894 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  30.1 
 
 		 855 aa  51.6  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 897 aa  51.6  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 922 aa  51.2  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 837 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 910 aa  50.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 912 aa  50.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 1136 aa  50.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 932 aa  50.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 931 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 931 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 931 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 931 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 931 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 931 aa  50.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 904 aa  50.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 164 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 848 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  56.76 
 
 		 944 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  85.71 
 
 		 151 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 837 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 914 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  67.86 
 
 		 161 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 1029 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  66.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 858 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 920 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 896 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  54.05 
 
 		 909 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  45.65 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 914 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 		 915 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 164 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 933 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  31.46 
 
 		 901 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 160 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  73.91 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 909 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 866 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  69.57 
 
 		 421 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  69.23 
 
 		 161 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  75 
 
 		 267 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  70.37 
 
 		 419 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  29.81 
 
 		 544 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  75 
 
 		 237 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 916 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  58.82 
 
 		 912 aa  47.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  56.76 
 
 		 135 aa  47.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 858 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 912 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 958 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 957 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 924 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 888 aa  47.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 930 aa  47.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 949 aa  47.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 931 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  40.32 
 
 		 869 aa  47.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 931 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 932 aa  47.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 932 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 		 911 aa  47.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 932 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 932 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 868 aa  47.4  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 162 aa  47.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  43.08 
 
 		 221 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 901 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  43.08 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  43.08 
 
 		 221 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  43.08 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>