16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2736 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2267  tetratricopeptide TPR_2  52.04 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  47.2 
 
 		 489 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.8 
 
 		 495 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3973  hypothetical protein  41.5 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.84 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  41.77 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2741  hypothetical protein  34.65 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.566816  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4486  hypothetical protein  56.99 
 
 		 124 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.271676  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  27.57 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  26.78 
 
 		 658 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0674  hypothetical protein  27.7 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000249433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4737  ShiA-like protein  26.32 
 
 		 347 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2144  SecC motif-containing protein  31.18 
 
 		 601 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03517  ShiA-like protein  26.32 
 
 		 347 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03469  hypothetical protein  26.32 
 
 		 347 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>