17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2267 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2267  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  51.44 
 
 		 269 aa  245  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  49.38 
 
 		 489 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.92 
 
 		 495 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  45.8 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3973  hypothetical protein  39.11 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2741  hypothetical protein  36.61 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.566816  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4486  hypothetical protein  78.72 
 
 		 124 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.271676  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.66 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  29.02 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03469  hypothetical protein  27.72 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03517  ShiA-like protein  27.72 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4737  ShiA-like protein  29.81 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 795 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0674  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000249433 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2283  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.976866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  30.07 
 
 		 658 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>