15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3919 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 495 aa  1026    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2267  tetratricopeptide TPR_2  49.1 
 
 		 285 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  47.58 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  43.8 
 
 		 269 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  44.94 
 
 		 287 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2741  hypothetical protein  39.37 
 
 		 259 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.566816  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3973  hypothetical protein  40.41 
 
 		 290 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.01 
 
 		 278 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4486  hypothetical protein  54.26 
 
 		 124 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.271676  normal  0.111915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03517  ShiA-like protein  29.44 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03469  hypothetical protein  29.44 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4737  ShiA-like protein  29.44 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0674  hypothetical protein  24.86 
 
 		 294 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000249433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2144  SecC motif-containing protein  27.86 
 
 		 601 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>