37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2144 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2144  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 601 aa  1182    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  28.42 
 
 		 658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  31.18 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2687  SEC-C motif domain protein  54.76 
 
 		 337 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.182718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  37.4 
 
 		 287 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  25.28 
 
 		 284 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  57.14 
 
 		 921 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  68.18 
 
 		 420 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  54.29 
 
 		 921 aa  46.2  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 912 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  23.65 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 911 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 1029 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  52.78 
 
 		 864 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  41.07 
 
 		 834 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 848 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 928 aa  44.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 278 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 911 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 911 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 939 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  43.64 
 
 		 908 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  43.64 
 
 		 908 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  43.64 
 
 		 908 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  36.99 
 
 		 912 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 1031 aa  44.3  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  71.43 
 
 		 909 aa  44.3  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  54.84 
 
 		 920 aa  44.3  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  38.46 
 
 		 970 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  62.5 
 
 		 202 aa  43.9  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 845 aa  43.9  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  31.39 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 894 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  65.38 
 
 		 225 aa  43.9  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 858 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 910 aa  43.9  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>