120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2687 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2687  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 337 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.182718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2144  SecC motif-containing protein  54.76 
 
 		 601 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11973  hypothetical protein  64.29 
 
 		 196 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  65.52 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  61.54 
 
 		 420 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2191  preprotein translocase, SecA subunit  57.58 
 
 		 928 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  57.14 
 
 		 848 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 897 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  43.08 
 
 		 956 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  65.38 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 864 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0361  preprotein translocase subunit SecA  25.99 
 
 		 910 aa  47.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.746169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 896 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 899 aa  47  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  52.63 
 
 		 844 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 834 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  40.32 
 
 		 888 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  62.07 
 
 		 921 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  59.26 
 
 		 845 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  94.12 
 
 		 864 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 912 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 858 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  72.73 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 		 911 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  76.19 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 		 909 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 855 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 894 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 838 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 859 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 		 911 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 911 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 866 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  54.29 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  47.83 
 
 		 1031 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 837 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  26.81 
 
 		 910 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  83.33 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  46.43 
 
 		 994 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  80 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 954 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  76.19 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 		 939 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  83.33 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  47.37 
 
 		 916 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  47.37 
 
 		 913 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  83.33 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  73.68 
 
 		 920 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  76.19 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  83.33 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 957 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  43.4 
 
 		 908 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  38.61 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  78.95 
 
 		 61 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3208  SecC motif-containing protein  47.22 
 
 		 544 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  59.26 
 
 		 910 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 		 971 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 		 869 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 971 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 958 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 859 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 110 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 1136 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 1018 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 836 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 881 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 922 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  51.85 
 
 		 835 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  55.88 
 
 		 906 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  75 
 
 		 167 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  88.24 
 
 		 855 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 921 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 837 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  70 
 
 		 993 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  51.35 
 
 		 908 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  51.35 
 
 		 908 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  51.35 
 
 		 908 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  56.67 
 
 		 833 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 908 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 908 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  57.69 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 908 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  60.71 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 911 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  65 
 
 		 925 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 896 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  78.95 
 
 		 535 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  75 
 
 		 235 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3857  putative cytoplasmic protein  82.35 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 907 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 111 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  59.26 
 
 		 1029 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  51.85 
 
 		 835 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  51.85 
 
 		 835 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  51.85 
 
 		 835 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>