18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1474 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1009    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  47.2 
 
 		 269 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2267  tetratricopeptide TPR_2  49.32 
 
 		 285 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.58 
 
 		 495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  41.39 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2741  hypothetical protein  35.17 
 
 		 259 aa  163  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.566816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.85 
 
 		 278 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3973  hypothetical protein  41.25 
 
 		 290 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4486  hypothetical protein  51.61 
 
 		 124 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.271676  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  26.87 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03517  ShiA-like protein  29.27 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03469  hypothetical protein  29.27 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  27.76 
 
 		 658 aa  57  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4737  ShiA-like protein  27.57 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0848  hypothetical protein  23.84 
 
 		 162 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000946347  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.67 
 
 		 1154 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1888  hypothetical protein  24.71 
 
 		 177 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00628072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.1 
 
 		 245 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>