16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2741 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2741  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  527  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.566816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.37 
 
 		 495 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  35.17 
 
 		 489 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2267  tetratricopeptide TPR_2  37.16 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  34.65 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  29.66 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3973  hypothetical protein  34.16 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.95 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4486  hypothetical protein  36.61 
 
 		 124 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.271676  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  23.08 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03517  ShiA-like protein  27.74 
 
 		 347 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03469  hypothetical protein  27.74 
 
 		 347 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4737  ShiA-like protein  27.1 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 878 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.36 
 
 		 810 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0131  hypothetical protein  24.5 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.659387  normal  0.970051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>