13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03469 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03517  ShiA-like protein  100 
 
 		 347 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4737  ShiA-like protein  94.52 
 
 		 347 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03469  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.44 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  26.51 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2267  tetratricopeptide TPR_2  29.19 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  28.15 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  29.27 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3973  hypothetical protein  25.9 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0674  hypothetical protein  31.2 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000249433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2741  hypothetical protein  27.74 
 
 		 259 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.566816  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>