13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3973 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3973  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2736  tetratricopeptide TPR_2  41.5 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.059738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2267  tetratricopeptide TPR_2  39.67 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.49 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1474  hypothetical protein  41.25 
 
 		 489 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1731  tetratricopeptide TPR_2  39.51 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2741  hypothetical protein  34.16 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.566816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.35 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4486  hypothetical protein  47.87 
 
 		 124 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.271676  normal  0.111915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03517  ShiA-like protein  25.9 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03469  hypothetical protein  25.9 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2917  hypothetical protein  24.51 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4737  ShiA-like protein  25.5 
 
 		 347 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>