265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3272 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  100 
 
 
669 aa  1303    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3536  hypothetical protein  31.09 
 
 
452 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  28.28 
 
 
457 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4637  hypothetical protein  28.42 
 
 
483 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3727  hypothetical protein  29.51 
 
 
374 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.754077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  27.48 
 
 
864 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5094  hypothetical protein  29.35 
 
 
454 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.617141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  26.91 
 
 
855 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  29.41 
 
 
286 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  29.44 
 
 
284 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 
968 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  57.14 
 
 
935 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 
910 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 
863 aa  52.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 
949 aa  52.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 
868 aa  52  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0063  hypothetical protein  30.41 
 
 
337 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 
862 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 
869 aa  51.2  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 
947 aa  51.2  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  72.41 
 
 
899 aa  51.2  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 
862 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 
862 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  51.28 
 
 
908 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  51.28 
 
 
908 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  51.28 
 
 
908 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 
915 aa  50.8  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 
914 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 
914 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  48.94 
 
 
939 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  51.16 
 
 
903 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  47.73 
 
 
342 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  45.07 
 
 
378 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 
909 aa  50.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 
1075 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 
944 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 
962 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  76.92 
 
 
962 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 
917 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  51.16 
 
 
911 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  56.41 
 
 
884 aa  49.3  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 
900 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 
962 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
901 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 
939 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 
1067 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  37.84 
 
 
112 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 
916 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 
916 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 
997 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  60.61 
 
 
325 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  64.29 
 
 
971 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 
844 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 
842 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  50 
 
 
319 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  37.78 
 
 
936 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  60 
 
 
384 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 
916 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 
904 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 
291 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 
911 aa  48.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 
897 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  94.12 
 
 
955 aa  48.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 
933 aa  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 
1018 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  43.75 
 
 
919 aa  48.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 
1113 aa  47.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  94.12 
 
 
935 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0249781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 
912 aa  47.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  57.14 
 
 
235 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 
291 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 
915 aa  47.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 
291 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 
900 aa  47.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  58.62 
 
 
958 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
916 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 
906 aa  47.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
904 aa  47.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  80 
 
 
909 aa  47.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 
906 aa  47.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
904 aa  47.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
909 aa  47.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  58.62 
 
 
963 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  25.76 
 
 
731 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 
904 aa  47.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 
906 aa  47.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>