289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1290 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 457 aa  934    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  30.86 
 
 		 266 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3536  hypothetical protein  29.51 
 
 		 452 aa  93.2  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  26.91 
 
 		 669 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4637  hypothetical protein  24.94 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  26.42 
 
 		 864 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  25.84 
 
 		 855 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5094  hypothetical protein  25 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.617141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  28.03 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  25.57 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  42.17 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  40 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  50.94 
 
 		 104 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0063  hypothetical protein  36 
 
 		 337 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1402  hypothetical protein  26.56 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 718 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  78.26 
 
 		 830 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3727  hypothetical protein  26.88 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.754077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3208  SEC-C motif domain protein  38.1 
 
 		 69 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 1136 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 872 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 910 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 864 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 888 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0739  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 96 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 866 aa  50.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 1200 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 848 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  55 
 
 		 297 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 833 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 896 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 849 aa  50.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 1277 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  85 
 
 		 834 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 897 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 618 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  70.83 
 
 		 318 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 910 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0468  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3561  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  72 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  72.73 
 
 		 901 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  80.95 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 921 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 858 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 859 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 838 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 836 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  65.38 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  61.54 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  72.73 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  81.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  81.82 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 836 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  64.29 
 
 		 585 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 835 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 844 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 1017 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 857 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  77.27 
 
 		 228 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  78.26 
 
 		 267 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  61.54 
 
 		 291 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  85 
 
 		 228 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  80.95 
 
 		 222 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  78.26 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 535 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  70.83 
 
 		 239 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 837 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3412  NERD domain-containing protein  77.27 
 
 		 722 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 992 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 980 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 917 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  86.36 
 
 		 166 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  62.96 
 
 		 235 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 800 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  77.27 
 
 		 249 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 933 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 922 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 842 aa  47  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 840 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 845 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  85 
 
 		 152 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>