10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1402 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1402  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  926    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2413  hypothetical protein  35.71 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000137766  normal  0.308809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1029  hypothetical protein  34.13 
 
 
410 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  24.9 
 
 
286 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  25.7 
 
 
284 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  22.8 
 
 
325 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  26.56 
 
 
457 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3177  hypothetical protein  29 
 
 
422 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000125478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  25.86 
 
 
864 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  23.2 
 
 
288 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>