136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2575 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  226  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  62.73 
 
 		 110 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  57.01 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  54.05 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  53.27 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  53.27 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  53.27 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  53.27 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  54.21 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  54.21 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  50.91 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  51.35 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  46.36 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  45.79 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  47.27 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  50.53 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  47.37 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 1029 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 272 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  74.07 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  69.23 
 
 		 432 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  85.71 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 855 aa  47.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 888 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  41.27 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 838 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  54.05 
 
 		 1031 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  77.27 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  33.01 
 
 		 319 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  50 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  31.19 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 921 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  63.64 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  43.4 
 
 		 897 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  85 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  60.71 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  85 
 
 		 420 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 593 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  80.95 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 845 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 866 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  63.33 
 
 		 291 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 1017 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 384 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1635  hypothetical protein  62.5 
 
 		 429 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.223926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 535 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  45 
 
 		 957 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 896 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 834 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 864 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 896 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  41.51 
 
 		 830 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2581  SecC motif-containing protein  78.95 
 
 		 426 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00102594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  88.89 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  63.33 
 
 		 419 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  78.95 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  89.47 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  72.73 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  44.23 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 859 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  54.84 
 
 		 836 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  58.06 
 
 		 910 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  88.24 
 
 		 731 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  62.5 
 
 		 909 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  88.24 
 
 		 378 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 848 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 858 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  58.06 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 912 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 800 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  73.91 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  54.29 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  78.95 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 958 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  63.64 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  63.64 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 161 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  34.88 
 
 		 896 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4839  hypothetical protein  77.78 
 
 		 658 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  88.89 
 
 		 167 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  34.67 
 
 		 944 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 1200 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  88.24 
 
 		 731 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 291 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 844 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 921 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 291 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  84.21 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  88.89 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  73.68 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  78.95 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>