More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1292 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  63.96 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  63.06 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  63.06 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  63.06 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  60.36 
 
 		 111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  61.26 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  58.56 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  54.95 
 
 		 112 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  53.15 
 
 		 112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  59.26 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  46.85 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  47.22 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  44.44 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  42.11 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  42.59 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  35.05 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  70.37 
 
 		 432 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  41.38 
 
 		 897 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  44.44 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  58.06 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  81.82 
 
 		 259 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  43.66 
 
 		 944 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  66.67 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  85 
 
 		 309 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  45.28 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 855 aa  47.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  33.33 
 
 		 836 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  64.29 
 
 		 1075 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  33.93 
 
 		 864 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  69.57 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  36.67 
 
 		 319 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 834 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  88.89 
 
 		 909 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 731 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  32.43 
 
 		 838 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  32.81 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  33.33 
 
 		 1027 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  68.97 
 
 		 272 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 		 962 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  39.13 
 
 		 848 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  88.24 
 
 		 585 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  29.31 
 
 		 858 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  56.76 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  67.86 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  53.33 
 
 		 921 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 859 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 866 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  94.12 
 
 		 875 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 896 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  73.33 
 
 		 962 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  94.12 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  94.12 
 
 		 235 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  94.12 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 894 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  45.76 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  52.63 
 
 		 1200 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 		 962 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 836 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 859 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  52.38 
 
 		 970 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 912 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 888 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 845 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 1031 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  46.51 
 
 		 800 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 1018 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  41.89 
 
 		 837 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 1017 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 907 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  94.12 
 
 		 378 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  69.23 
 
 		 314 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  38.46 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 915 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 844 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  60 
 
 		 264 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 958 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  75 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 958 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 957 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  94.12 
 
 		 488 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  88.24 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  88.24 
 
 		 286 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  75 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  88.89 
 
 		 253 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>