142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1393 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  225  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  62.73 
 
 		 110 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  64.81 
 
 		 111 aa  150  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  62.96 
 
 		 111 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  63.3 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  63.3 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  63.3 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  63.3 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  63.3 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  58.33 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  56.88 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  52.73 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  52.78 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  50.91 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  61.05 
 
 		 111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  47.27 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  47.75 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 855 aa  50.4  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  62.96 
 
 		 432 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  40.62 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  43.28 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 888 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 1031 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  69.23 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  38.16 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 838 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  65.52 
 
 		 272 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  76.19 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  54.05 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 958 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 957 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 1027 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  50 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  60.71 
 
 		 830 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  75 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 1029 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  56.67 
 
 		 291 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 1017 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  28.57 
 
 		 864 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  38.37 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  57.14 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 910 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  37.89 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 836 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 845 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  34.34 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 896 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 896 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  36.67 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  38.03 
 
 		 906 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  56.67 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 912 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  28.04 
 
 		 844 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  73.68 
 
 		 848 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 894 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  35.48 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 1024 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 		 866 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  36.23 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  63.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  77.78 
 
 		 859 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  41.67 
 
 		 384 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  51.43 
 
 		 162 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  77.78 
 
 		 235 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  66.67 
 
 		 318 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  55.17 
 
 		 907 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  77.78 
 
 		 535 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 618 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 291 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  77.78 
 
 		 291 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  24.27 
 
 		 836 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  69.57 
 
 		 955 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0418  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 335 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  53.85 
 
 		 274 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  77.78 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  58.62 
 
 		 909 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  60 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 903 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 		 800 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>