90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2967 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  100 
 
 
114 aa  235  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  50 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  50 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  50 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  49.12 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  49.12 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  47.37 
 
 
111 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  49.14 
 
 
112 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  47.37 
 
 
111 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  47.75 
 
 
110 aa  103  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  44.74 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  45.69 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  47.37 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  42.34 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  43.24 
 
 
110 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  42.34 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  42.11 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  33.93 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  33.04 
 
 
175 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  33.93 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  40.51 
 
 
283 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  47.4  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  35.62 
 
 
221 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  56.67 
 
 
278 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  56.67 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  59.26 
 
 
276 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  59.26 
 
 
276 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  37.68 
 
 
896 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 
1029 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  61.54 
 
 
432 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  54.05 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  40.35 
 
 
897 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  69.57 
 
 
420 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  35.87 
 
 
1027 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  54.84 
 
 
225 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  64 
 
 
259 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 
1031 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  35.71 
 
 
907 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 
1017 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  45.45 
 
 
800 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 
419 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  28.57 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  53.33 
 
 
228 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  42.55 
 
 
314 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  38.03 
 
 
1024 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 
958 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  33.65 
 
 
163 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0335  hypothetical protein  75 
 
 
544 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.819744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  75 
 
 
231 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 
957 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 
888 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 
160 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  89.47 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  77.78 
 
 
257 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  41.51 
 
 
281 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  56.67 
 
 
264 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  83.33 
 
 
267 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  83.33 
 
 
237 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  29.27 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  54.84 
 
 
309 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  56.67 
 
 
209 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  56.67 
 
 
1075 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  41.86 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  41.67 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  56.67 
 
 
260 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  28.44 
 
 
944 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
858 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 
1200 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00180  methionine aminopeptidase, type I  84.21 
 
 
290 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.55421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  32 
 
 
160 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  77.78 
 
 
593 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 
864 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  35.71 
 
 
906 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  61.54 
 
 
830 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 
845 aa  40  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  41.46 
 
 
319 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  31.52 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  41.67 
 
 
164 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 
855 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  41.67 
 
 
164 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  37.14 
 
 
910 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>