132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1635 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1635  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  876    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.223926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2581  SecC motif-containing protein  52.79 
 
 		 426 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00102594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  61.76 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  64.71 
 
 		 845 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 		 907 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  56.41 
 
 		 888 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 864 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 906 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 894 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  30.57 
 
 		 166 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  36.76 
 
 		 1029 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  50 
 
 		 264 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 593 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  52.78 
 
 		 910 aa  47  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  34.85 
 
 		 837 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 897 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 836 aa  47  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 		 859 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  94.44 
 
 		 272 aa  47  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  45.65 
 
 		 1136 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 859 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  32.46 
 
 		 881 aa  46.6  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  42 
 
 		 907 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 912 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 921 aa  46.6  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 834 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 1031 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  60 
 
 		 235 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 896 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  58.82 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  27.78 
 
 		 835 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 896 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  78.95 
 
 		 909 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  34.34 
 
 		 830 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  94.44 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  31.48 
 
 		 848 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  89.47 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  55.56 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  48.65 
 
 		 869 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  23.68 
 
 		 921 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 866 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  45.28 
 
 		 239 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  39.66 
 
 		 844 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 958 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  42.22 
 
 		 893 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1532  SEC-C motif domain protein  68 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000744223  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  84.21 
 
 		 110 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  88.89 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 855 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  40 
 
 		 906 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  48.65 
 
 		 253 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  28.57 
 
 		 837 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 908 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  54.55 
 
 		 112 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 908 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  54.55 
 
 		 112 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  25.56 
 
 		 836 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 909 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 908 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  54.55 
 
 		 112 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  38.78 
 
 		 237 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  38.78 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  56.41 
 
 		 1067 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 838 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  41.38 
 
 		 135 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 872 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  56.76 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 957 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  46.34 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 911 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  54.55 
 
 		 112 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  46.51 
 
 		 922 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  47.22 
 
 		 903 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  88.89 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  52.63 
 
 		 110 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  64.29 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  56.67 
 
 		 225 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 858 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  54.55 
 
 		 112 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  88.89 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  42.55 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  83.33 
 
 		 239 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  78.95 
 
 		 1200 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 920 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  24 
 
 		 162 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  59.38 
 
 		 111 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1973  SecC motif-containing protein  69.57 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>