145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3352 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3214  SEC-C motif domain protein  97.41 
 
 		 428 aa  788    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3352  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 429 aa  874    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3210  SEC-C motif domain protein  44.49 
 
 		 444 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000775397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3349  SEC-C motif domain protein  44.27 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3177  hypothetical protein  28.97 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000125478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  29.02 
 
 		 731 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  28.9 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 916 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 935 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 939 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 933 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 869 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 968 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 857 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 921 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 859 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2505  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 981 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 836 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 845 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 837 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 1136 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 910 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  89.47 
 
 		 912 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  84.21 
 
 		 830 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 912 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  41.07 
 
 		 875 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 845 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 840 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  84.21 
 
 		 901 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 881 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 910 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 922 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 896 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  84.21 
 
 		 909 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 912 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 912 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  26.04 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 863 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  85 
 
 		 868 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  40.23 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 932 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 1031 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 905 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 862 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 905 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  75 
 
 		 235 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 911 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 930 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 855 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 862 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 894 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2518  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 903 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 862 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0389  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 110 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  84.21 
 
 		 903 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 898 aa  45.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 833 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 859 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 921 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 837 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 904 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 930 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 980 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 949 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  57.14 
 
 		 266 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 872 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  65.22 
 
 		 931 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  88.24 
 
 		 858 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 888 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 909 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 1022 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 906 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003258  YgfB and YecA  72.73 
 
 		 236 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 893 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 836 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 958 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 910 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 921 aa  43.9  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 1029 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 1024 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>