More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11395 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  100 
 
 
653 aa  1307    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  37.3 
 
 
666 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1923  stage II sporulation E family protein  38.01 
 
 
511 aa  204  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
1711 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.55 
 
 
828 aa  180  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
1385 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  34.48 
 
 
851 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
1361 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  32.63 
 
 
537 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 
1017 aa  170  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  33.05 
 
 
618 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1390 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
1370 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
1383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  36.86 
 
 
772 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  34.84 
 
 
502 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.07 
 
 
738 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.6 
 
 
549 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1248 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.2 
 
 
952 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 
855 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 
574 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  27.75 
 
 
697 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.29 
 
 
573 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  37.24 
 
 
713 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.3 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.21 
 
 
560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.8 
 
 
1051 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
693 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 
528 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  30.62 
 
 
670 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  32.13 
 
 
1225 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.56 
 
 
692 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  37.11 
 
 
755 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.65 
 
 
579 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.05 
 
 
616 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
1432 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  28.54 
 
 
817 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  30.87 
 
 
591 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.56 
 
 
1045 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 
692 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.2 
 
 
847 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  41.18 
 
 
260 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 
723 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
716 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  37.41 
 
 
652 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.74 
 
 
745 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.2 
 
 
453 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.5 
 
 
750 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.44 
 
 
713 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.86 
 
 
525 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.1 
 
 
697 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  30.55 
 
 
1039 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  32.21 
 
 
607 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  36.76 
 
 
694 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1092 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1086 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  35.98 
 
 
693 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.2 
 
 
642 aa  99  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 
409 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 
700 aa  98.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  35.18 
 
 
1086 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  35.45 
 
 
544 aa  98.2  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.36 
 
 
529 aa  98.2  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 
583 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  34.77 
 
 
570 aa  97.8  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  31.11 
 
 
746 aa  97.8  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.36 
 
 
688 aa  97.4  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.75 
 
 
567 aa  97.1  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
265 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  34.28 
 
 
308 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  29 
 
 
642 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
720 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  32.44 
 
 
607 aa  94.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  33.66 
 
 
688 aa  94.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 
760 aa  94  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  31.37 
 
 
721 aa  94.4  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  37.06 
 
 
627 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
966 aa  93.2  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.22 
 
 
775 aa  92.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  31.39 
 
 
614 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  36.41 
 
 
932 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 
546 aa  92  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.55 
 
 
450 aa  91.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  25.48 
 
 
519 aa  90.9  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  36.59 
 
 
730 aa  90.5  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 
583 aa  90.5  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 
760 aa  90.1  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  30.31 
 
 
618 aa  89.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 
709 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  33.33 
 
 
684 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.71 
 
 
678 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 
572 aa  89  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.65 
 
 
702 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.75 
 
 
585 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.07 
 
 
637 aa  87.8  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
427 aa  87.8  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5852  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.34 
 
 
424 aa  87.8  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910285  normal  0.678328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>