More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1923 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1923  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 511 aa  967    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  38.07 
 
 		 666 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  39.46 
 
 		 653 aa  223  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  35.5 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 1711 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  35.38 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 1361 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  35.51 
 
 		 851 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  35.93 
 
 		 1017 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 1385 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.72 
 
 		 828 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 1370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1390 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1390 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1390 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.6 
 
 		 1045 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.83 
 
 		 817 aa  123  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 1383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  32.05 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.88 
 
 		 952 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.54 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  41.58 
 
 		 574 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.78 
 
 		 616 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1248 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.65 
 
 		 697 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35 
 
 		 1051 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.64 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  42.93 
 
 		 1432 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.97 
 
 		 692 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 		 1225 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.31 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.75 
 
 		 692 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  34.59 
 
 		 1039 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.3 
 
 		 693 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  36.59 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  35.16 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  38.81 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.18 
 
 		 697 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  33.24 
 
 		 855 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.87 
 
 		 532 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 		 260 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.13 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 		 745 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  37.34 
 
 		 723 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  38.22 
 
 		 713 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  34.7 
 
 		 716 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.25 
 
 		 560 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 		 676 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.27 
 
 		 847 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  38.2 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.93 
 
 		 553 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  33.46 
 
 		 618 aa  98.6  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  33.58 
 
 		 700 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  41.63 
 
 		 757 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  32.9 
 
 		 771 aa  97.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 		 721 aa  96.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.62 
 
 		 775 aa  96.7  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  32.77 
 
 		 755 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 		 528 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  35.78 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  36.14 
 
 		 772 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.59 
 
 		 753 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  35.18 
 
 		 456 aa  94.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  34.69 
 
 		 713 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  38.92 
 
 		 614 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  36.79 
 
 		 693 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  34.56 
 
 		 709 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.06 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  30.4 
 
 		 776 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  31.1 
 
 		 765 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  37.1 
 
 		 570 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  35.53 
 
 		 760 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  37.43 
 
 		 643 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  38.2 
 
 		 652 aa  90.9  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 797 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.94 
 
 		 830 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  37.43 
 
 		 594 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  37.8 
 
 		 798 aa  90.5  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  33.59 
 
 		 670 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.29 
 
 		 750 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  32.08 
 
 		 576 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  41 
 
 		 738 aa  89.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  33.48 
 
 		 754 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  36.27 
 
 		 694 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  37.15 
 
 		 546 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.76 
 
 		 585 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 744 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  37.77 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  32.98 
 
 		 708 aa  87.4  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  37.38 
 
 		 570 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.68 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  31.6 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  37.43 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.53 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1818  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  35.64 
 
 		 932 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.92 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  35.95 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.47 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>