More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3101 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  67.92 
 
 		 296 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  44.16 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  46.84 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  47.76 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  39.93 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  40.52 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  40.52 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  40.52 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  40.52 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  39.5 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  39.15 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  40.15 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  41.11 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  38.54 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.93 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  38.19 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  36.81 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  38.19 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  37.85 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  37.93 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.8 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  36.11 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 		 294 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  35.76 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  35.76 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  37.94 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  38.77 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  38.77 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  38.77 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  40.08 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  36.98 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  31.89 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  33.45 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  39.06 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.13 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  33.21 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.7 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  33.59 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  31.25 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.54 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.15 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  30.36 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.15 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.15 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  30 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  29.15 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.82 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  28.78 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  30.24 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.88 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  28.78 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  28.78 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.9 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.34 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  26.85 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.34 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2094  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.03 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.34 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>