117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1872 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  30.21 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  28.65 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  29.34 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  29.13 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  29.13 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  29.13 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  28.34 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  29.83 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  26.56 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  27.69 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  27.6 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  28.06 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  26.18 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  25.79 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  25 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  24.62 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.29 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  25.26 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  27.6 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  22.41 
 
 
229 aa  61.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25.77 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  25.26 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  25.26 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  25.26 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  23.44 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  24.23 
 
 
211 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.3 
 
 
370 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  23.86 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  20.23 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  23.32 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  19.88 
 
 
456 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  24.23 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  23.6 
 
 
600 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  20.21 
 
 
205 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25.4 
 
 
213 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  21.81 
 
 
221 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  19.1 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  20.98 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  19.9 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  22.69 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  22.06 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  26.52 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  23.33 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  20.67 
 
 
360 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  20.4 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  20.67 
 
 
360 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  16.75 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  22.07 
 
 
360 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  22.05 
 
 
367 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  22.05 
 
 
367 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  21.14 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.12 
 
 
349 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  21.74 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  21.6 
 
 
360 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.61 
 
 
976 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  21.6 
 
 
360 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  21.6 
 
 
360 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  20.99 
 
 
886 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  21.28 
 
 
844 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  20.11 
 
 
363 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  25.4 
 
 
216 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  23.5 
 
 
218 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  24.06 
 
 
601 aa  44.3  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  21.13 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  28.08 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.43 
 
 
348 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  18.59 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  20.93 
 
 
358 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  21.5 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  22.51 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  21.54 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.41 
 
 
739 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  20.74 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.41 
 
 
739 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
485 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.41 
 
 
739 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  22.89 
 
 
343 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.24 
 
 
866 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  18.45 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  20.94 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03095  hypothetical protein  31.63 
 
 
379 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>