222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3550 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.96 
 
 		 3816 aa  734    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  66.58 
 
 		 2522 aa  2393    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  80.22 
 
 		 3699 aa  2134    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  42.63 
 
 		 2839 aa  1020    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  52.85 
 
 		 1911 aa  1360    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  54.37 
 
 		 3089 aa  1345    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  80.85 
 
 		 3699 aa  2135    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  38.33 
 
 		 2715 aa  796    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  74.96 
 
 		 3544 aa  1998    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  40.74 
 
 		 2153 aa  712    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  77.27 
 
 		 2503 aa  2900    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 2476 aa  4882    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  68.05 
 
 		 2042 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  65.56 
 
 		 2192 aa  467  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  34.02 
 
 		 2670 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.5 
 
 		 3477 aa  362  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  38.96 
 
 		 1480 aa  344  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1879 aa  285  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  34.58 
 
 		 2848 aa  278  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  56.78 
 
 		 1143 aa  268  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  34.2 
 
 		 1362 aa  248  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  43.82 
 
 		 2233 aa  195  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  38.66 
 
 		 3474 aa  186  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  30.27 
 
 		 3278 aa  180  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0168  hypothetical protein  81.25 
 
 		 135 aa  155  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0163  hypothetical protein  82.5 
 
 		 135 aa  155  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  34.35 
 
 		 2042 aa  145  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.76 
 
 		 994 aa  144  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.7 
 
 		 850 aa  129  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.45 
 
 		 2507 aa  123  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  41.75 
 
 		 731 aa  118  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  33 
 
 		 4231 aa  117  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  34.43 
 
 		 2820 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.83 
 
 		 1597 aa  117  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.59 
 
 		 761 aa  117  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  36.96 
 
 		 3598 aa  115  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  43.81 
 
 		 2853 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.5 
 
 		 2074 aa  114  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  43.43 
 
 		 4465 aa  107  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  30.4 
 
 		 892 aa  107  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.59 
 
 		 11716 aa  107  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.45 
 
 		 1884 aa  106  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.41 
 
 		 3927 aa  104  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  39.78 
 
 		 814 aa  104  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  38.17 
 
 		 1367 aa  100  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  41.62 
 
 		 2001 aa  100  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  38.97 
 
 		 1363 aa  99.4  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.34 
 
 		 4978 aa  98.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  27.61 
 
 		 9585 aa  98.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.8 
 
 		 3191 aa  97.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.19 
 
 		 4848 aa  97.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  30.35 
 
 		 2636 aa  95.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  33.97 
 
 		 721 aa  94.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  35 
 
 		 5745 aa  94  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.09 
 
 		 1550 aa  93.6  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  39.25 
 
 		 1502 aa  93.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.99 
 
 		 2816 aa  92  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  47.14 
 
 		 475 aa  90.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.5 
 
 		 2114 aa  90.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  32.11 
 
 		 715 aa  89.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  34.64 
 
 		 1268 aa  89  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.07 
 
 		 3363 aa  88.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  34.02 
 
 		 1215 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  35.64 
 
 		 2701 aa  88.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  35.75 
 
 		 1269 aa  88.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  34.02 
 
 		 1215 aa  87.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  35.64 
 
 		 1422 aa  85.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1061 aa  84  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  50.41 
 
 		 1848 aa  83.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.74 
 
 		 1215 aa  82.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  37.36 
 
 		 1002 aa  82.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.84 
 
 		 1215 aa  82  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  31.13 
 
 		 1269 aa  82  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.07 
 
 		 1628 aa  82.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  31.84 
 
 		 1215 aa  82  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  31.82 
 
 		 3244 aa  81.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  35.6 
 
 		 1408 aa  80.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  35.6 
 
 		 1410 aa  80.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  35.6 
 
 		 1410 aa  80.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  31.16 
 
 		 8321 aa  80.1  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1512 aa  78.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  35.66 
 
 		 1631 aa  78.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  34.48 
 
 		 2132 aa  78.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  38.46 
 
 		 5020 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  34.69 
 
 		 994 aa  76.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1066 aa  76.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.05 
 
 		 1750 aa  76.3  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  45.63 
 
 		 4022 aa  76.3  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.53 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  32.98 
 
 		 663 aa  75.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.17 
 
 		 2555 aa  75.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.1 
 
 		 1867 aa  75.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  32.23 
 
 		 1779 aa  74.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  42.48 
 
 		 1625 aa  74.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  32.04 
 
 		 2067 aa  74.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.48 
 
 		 2377 aa  73.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1439 aa  72.8  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.63 
 
 		 4798 aa  72.8  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.34 
 
 		 2807 aa  72.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  32.17 
 
 		 2039 aa  71.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>