More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6035 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 191 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 199 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 383 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  33.17 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.62 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  48.57 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.88 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  22.75 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  30.64 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  30.48 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
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