298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3709 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  100 
 
 		 237 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  48.52 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.48 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  26.53 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 186 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  37.86 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 98 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40.98 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  41.18 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 193 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  30.28 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 192 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 424 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>