140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1563 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1563  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  53.69 
 
 		 635 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  53.4 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  49.75 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5188  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0904  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  26.4 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 429 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 291 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  22.86 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  22.86 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  34.55 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  45.28 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  52.08 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  37.1 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  31.71 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  41.86 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>