More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  63.33 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  58.85 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  54.5 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  56.4 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  54.74 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  54.04 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  55.88 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  49.05 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  41.53 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  46.55 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  40.93 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  41.46 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  45.03 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  44.08 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  43.87 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  43.42 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  43.42 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  44.88 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  35.85 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  36.16 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  37.57 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44 
 
 		 240 aa  101  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  45.31 
 
 		 177 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  41.03 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  42 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  41.73 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  43.75 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  41.29 
 
 		 177 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  40.67 
 
 		 177 aa  98.2  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  42.86 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  37.99 
 
 		 181 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  35.62 
 
 		 168 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  39.1 
 
 		 170 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  35.67 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  42.97 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  36.88 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  38.67 
 
 		 177 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  34.78 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  32.91 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  35.62 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.5 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  36.88 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  38.12 
 
 		 175 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  39.74 
 
 		 177 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  43.31 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  36.88 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  33.95 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  38.96 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  38.67 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  35.58 
 
 		 168 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  41.29 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  36.16 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  36.31 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  36.18 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  36.93 
 
 		 172 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.25 
 
 		 187 aa  94.7  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  41.55 
 
 		 179 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.25 
 
 		 187 aa  94.7  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  36.88 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  37.27 
 
 		 172 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  43.2 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  35.85 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  36.2 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  36.2 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5119  peptide deformylase  33.54 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  38.34 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  32.45 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  38.61 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  38.67 
 
 		 177 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  43.95 
 
 		 157 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  34.38 
 
 		 168 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  42.54 
 
 		 171 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  39.75 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  36 
 
 		 185 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06160  peptide deformylase  34.72 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.16 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  35.81 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  35.22 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  33.33 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  35.22 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  35.48 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  34.97 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  35.22 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  39.07 
 
 		 174 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  43.23 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  45.76 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  38.99 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.49 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.49 
 
 		 167 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.25 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.62 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  35.95 
 
 		 167 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>