More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 204 aa  396  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  40.86 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  35.97 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.78 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  25.81 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  43.06 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>