More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3383 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  83.64 
 
 		 758 aa  1345    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  83.77 
 
 		 758 aa  1346    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  83.51 
 
 		 758 aa  1341    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 758 aa  1553    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  83.91 
 
 		 758 aa  1347    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 821 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 		 706 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  37.73 
 
 		 744 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 797 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 835 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 751 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  34.62 
 
 		 801 aa  429  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 689 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 689 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 682 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 734 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  36.48 
 
 		 687 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  36.34 
 
 		 687 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 682 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 680 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 692 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 693 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 694 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 681 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  35.55 
 
 		 681 aa  360  6e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 681 aa  360  7e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 685 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 742 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 677 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 677 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 719 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 730 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 694 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.68 
 
 		 600 aa  343  8e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 724 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 693 aa  335  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 695 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 681 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 681 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 751 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 698 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 698 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 751 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 698 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 705 aa  327  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 725 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 685 aa  324  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 709 aa  314  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  31.59 
 
 		 709 aa  307  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  29.34 
 
 		 778 aa  302  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 699 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 695 aa  294  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 709 aa  284  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 733 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 727 aa  275  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 713 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 708 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 		 744 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 702 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  31.67 
 
 		 685 aa  248  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 702 aa  244  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 676 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 707 aa  241  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 714 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 705 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 719 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 719 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 714 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 783 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 723 aa  223  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 731 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.04 
 
 		 782 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  28.09 
 
 		 774 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 702 aa  208  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 759 aa  200  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 784 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 784 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 789 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 766 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 799 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  25.16 
 
 		 868 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 763 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 735 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  40.95 
 
 		 836 aa  159  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 818 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  40.11 
 
 		 249 aa  135  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 824 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 730 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 776 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 678 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 780 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 732 aa  90.9  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  27.93 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 797 aa  82  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 698 aa  77.8  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  30.5 
 
 		 675 aa  77.4  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 776 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>