121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2926 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  87.94 
 
 		 258 aa  477  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  88.33 
 
 		 258 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  77.73 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  64.94 
 
 		 253 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  63.89 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  64.94 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  63.49 
 
 		 322 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  63.89 
 
 		 253 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.62 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  24.68 
 
 		 727 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  26.91 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  25.31 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  22.86 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  22.98 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  26.67 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  24.85 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.5 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  25.53 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  27.78 
 
 		 736 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  23.97 
 
 		 570 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  25.21 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  25.52 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  21.1 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  22.82 
 
 		 714 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  22.54 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  23.36 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  23.32 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  24.11 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  22.13 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  22.13 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  24.11 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  24.04 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  24.42 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1213  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2292  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  24.8 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  25 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  22.94 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.23 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  22.98 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  22.92 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 843 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  28.83 
 
 		 565 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  22.84 
 
 		 478 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  21.4 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 1410 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  23.04 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1419  hypothetical protein  24.23 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  17.74 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  26.88 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 780 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2732  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  20.74 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  22.79 
 
 		 794 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  23.08 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  23.15 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  21.53 
 
 		 934 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1245 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  26.88 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.2 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  21.29 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  25.6 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 1089 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  22.81 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  26.85 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  23.89 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  23.81 
 
 		 714 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 729 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  22.84 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  23.74 
 
 		 598 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1594  arginine-binding protein  24 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  22.84 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0591  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  24 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0748117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>