46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06790 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  57.42 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  47.92 
 
 
247 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  49.6 
 
 
241 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  47.92 
 
 
247 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  48.52 
 
 
247 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  51.17 
 
 
247 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  50.62 
 
 
248 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  51.45 
 
 
247 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  30.08 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  30.47 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  22.97 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  22.27 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  25.24 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  22.17 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  22.49 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  22.05 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  22.64 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  21.5 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  22.06 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  23.94 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  23.94 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  23.94 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  26.29 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.56 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  23.04 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  22.49 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4074  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  25.37 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.04 
 
 
299 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1047  hypothetical protein  25.87 
 
 
258 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  30.83 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12650  hypothetical protein  30.32 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  22.27 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
305 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.05 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3638  extracellular solute-binding protein family 3  25.67 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  20.17 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  22.97 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.85 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 
253 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>