63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0556 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  510  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  95.55 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  91.5 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  87.04 
 
 		 247 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  60.43 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  54.92 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  51.87 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  46.84 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  48.66 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  25.11 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  24.77 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  26.21 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  25.82 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  27.16 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  24.77 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  24.58 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  24.11 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  24.27 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  23.75 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  23.66 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  23.66 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.71 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  23.21 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  23.79 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  21.55 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  26.14 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  21.76 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  23.15 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  22.36 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.22 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  24.6 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.69 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  23.29 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  24.3 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4168  extracellular solute-binding protein  20.17 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  22.39 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  21.59 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3338  amino acid ABC transporter  25.55 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2779  amino acid ABC transporter  22.07 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.38 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  26.67 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  27.39 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1924  hypothetical protein  22.01 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4859  putative cation efflux protein  22.43 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5515  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  26.67 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  hitchhiker  0.00100925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  25.62 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  21.83 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  19.62 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  22.93 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>