39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4452 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  95.51 
 
 		 246 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  95.1 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  95.1 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  69.87 
 
 		 241 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  69.46 
 
 		 241 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  67.63 
 
 		 241 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  69.67 
 
 		 244 aa  344  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  70.89 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  57.14 
 
 		 261 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  54.25 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  50.7 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  42.92 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  24.35 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  26.5 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  25.32 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  26.45 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  23.66 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  21.74 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  23.21 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  24.02 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  24.24 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.77 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  23.51 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.57 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.71 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  23.04 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.22 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.05 
 
 		 258 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  26.15 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  21.62 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  23.86 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  25.52 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.28 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  22.35 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>