57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  93.15 
 
 		 247 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  47.68 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  47.26 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  45.75 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  48.29 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  45.93 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  48.32 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  52.27 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  32.71 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  31.43 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  27.54 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  27.95 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  27.01 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  25.32 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  25.53 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  25.32 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  25.53 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  25.75 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  25.32 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  24.68 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  25.85 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  24.14 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  27.2 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  23.28 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  23.32 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  25.74 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  19.56 
 
 		 303 aa  52  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  21.24 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  20.56 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4168  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  20.56 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  20.95 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0352  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.55 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  20.41 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  19.51 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  20.09 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  19.53 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 457 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  20.8 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.67 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  26.12 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.79 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  22.55 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  20.68 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  21.89 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.64 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  19.72 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  20.45 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3737  hypothetical protein  28.99 
 
 		 244 aa  42  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2107  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.46 
 
 		 253 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>