45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0129 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  71.95 
 
 		 226 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  54.08 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  58.13 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  53.65 
 
 		 246 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  53.65 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  52.61 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  53.22 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  51.3 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  52.17 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  48.42 
 
 		 241 aa  232  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  46.47 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  44.26 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  28.8 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  28.46 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  23.74 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  25.31 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  24.7 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  23.36 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  25.82 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  22.97 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  24.88 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3539  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.5 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.07 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.43 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1619  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.45 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  19.61 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  21.03 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  19.83 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  19.22 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  19.51 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  19.4 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  23.21 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  22.44 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  29.87 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4186  extracellular solute-binding protein family 3  25.83 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  20.18 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  23.35 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>