32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0639 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  28.44 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  28.31 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  27.95 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  26.92 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  25.82 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  25.43 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  25.51 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  26.45 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  24.77 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  25.21 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  25.65 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  22.94 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  22.18 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  23.53 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  21.76 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  24.37 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  22.77 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  23.76 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  23.76 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  22.17 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  23.76 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.72 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3862  hypothetical protein  26.64 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  29.89 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  24.35 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  19.01 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 292 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  26.44 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>