29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0129 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  50.7 
 
 		 245 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  49.09 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  49.09 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  44.44 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  48.64 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  44.02 
 
 		 241 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  43.59 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  46.76 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  48.1 
 
 		 244 aa  208  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  45.24 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  38.49 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  26.61 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  27.47 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  25.21 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  23.75 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  23.61 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  24.07 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  23.73 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  25.24 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  24.28 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.51 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  30.67 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  26.72 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  19.01 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 262 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>