41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3678 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  50.96 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  50.69 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  45.06 
 
 		 241 aa  222  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  47.34 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  44.21 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  43.78 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  44.93 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  41.67 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  42.92 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  41.25 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  41.25 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  39.39 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  24.79 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  23.28 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  22.75 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  21.55 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  23.08 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  22.22 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  24.79 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  22.13 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  21.6 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  24.65 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  22.91 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  25.23 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  24.07 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.4 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  22.75 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.13 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.76 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0214  hypothetical protein  23.05 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169583  normal  0.379384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4125  hypothetical protein  23.05 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000533032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0212  hypothetical protein  23.05 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000116601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  25.1 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.4 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0290  ABC transporter, substrate-binding protein  21.97 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3223  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4246  hypothetical protein  22.63 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000185184  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  22.92 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  25.7 
 
 		 259 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>