42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4714 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4714  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3869  hypothetical protein  84.23 
 
 		 241 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.013789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3962  hypothetical protein  83.82 
 
 		 241 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4072  hypothetical protein  82.57 
 
 		 241 aa  420  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4452  hypothetical protein  67.23 
 
 		 245 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4312  hypothetical protein  65.84 
 
 		 246 aa  341  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0406875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4257  hypothetical protein  65.43 
 
 		 246 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0087  hypothetical protein  65.43 
 
 		 246 aa  337  9e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.621841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3874  hypothetical protein  70.33 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0129  hypothetical protein  48.42 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0129  hypothetical protein  44.77 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00774335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0092  hypothetical protein  49.06 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00199645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3678  hypothetical protein  44.73 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.33972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5012  hypothetical protein  23.48 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0521  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0556  hypothetical protein  24.45 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0567  hypothetical protein  23.83 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0574  hypothetical protein  23.14 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3850  hypothetical protein  23.58 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11480  hypothetical protein  24.27 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1052  hypothetical protein  25.21 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6269  hypothetical protein  27.18 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72220  hypothetical protein  27.49 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06790  hypothetical protein  22.17 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0639  hypothetical protein  22.77 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.87 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  24.24 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  25.39 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  22.22 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0574  putative cation efflux protein  22.37 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0793473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3673  putative cation efflux protein  24.61 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2795  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  32.26 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  22.86 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  23.98 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 274 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  34.29 
 
 		 274 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 274 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>